A ver si podemos ayudarte porque creo que, o no te he entendido bien o te estas liando, las horquillas al ser manuales me imagino que serán como las de la foto. Esos números que ves del 1 al 10 que se regulan con un destornillador plano son para la extensión y compresión (lo rápido que quieres que se hunda y recupere), si no vas a circuito y el uso es normal de fines de semana, déjatelos que el punto este en el 5.
Ahora entramos en el otro tema, que es que te llega al final de su recorrido al frenar, es decir, te hace tope porque esta muy blanda. Eso se regula con el tornillo negro que esta en la barra derecha,
https://www.manualpdf.es/bmw/s-1000-rr-2020/manual?p=126, aquí te lo explica, en tu manual también lo tienes, si lo giras hacia la izquierda se vuelve mas blanda, a derechas mas dura. Para que la moto funcione bien tienes que regular la suspensión delantera y trasera para que estén en los valores a tu peso, lo que se denomina hacer el SAG, la moto viene tarada para una persona de 85kg.
Espero haberte ayudado, si nunca has regulado una suspensión, pregúntale a algún amigo o llévala a algún taller y que te lo expliquen un poco.