Lo he sacado de un foro, no he ido en mi P+++a vida a Berlin, ;D ;D ;D
Depende de lo que quieras encontrar. Si quieres ir de bares por una zona "cool" ve a Prenzlauer Berg. Coge el metro (U2) hasta Schönhauser Allee y sigue andando por la Kastanienallee. Ahí encontrarás mogollón de bares. Hay un Biergarten (equivalente alemán de terraza) que se llama Prater, y por lo visto ponen muy buena comida. Yo recomiendo normalmente un bar que se llama Oderquelle, que está en la Oderbergerstrasse. Es chiquitito pero se está muy agusto, y para estar tranquilo mola. Por esa zona hay mogollón de cosas, seguro que encuentras algo.
Si quieres algo un poco más "alternativo" puedes ir a Friedrichschein. Desde Warschauerstrasse (s-bahn) hasta Magdalenenstrasse (u-5) está lleno de bares y clubs. Es en esta zona donde están los famosos bares subterráneos de Berlín. La Simon-Dach-Strasse puede ser un buen lugar para empezar la noche, o para ir a Brunch el domingo.
Si, por el contrario, quieres un ambiente más "bohemio" puedes empezar por Kreuzberg: hay bares como Le Bateau Ivre o Zum Elephanten que están muy bien. Esta zona (Görlitzer Bahnhof) también está guay para ir de After. En la Wiener Strasse tienes el Wiener Blut (abierto hasta las 4) desde el que puedes ir al Wild at Heart (abierto hasta las 7) y acabar en el Bar Elf (nunca vi cuándo lo cerraban). Al lado de este último tienes una panadería para desayunar.
Y si lo que te interesa es algo más rollo discoteca grande, puedes ir al Knaack y al Magnet (más alternativo, en Friedrichshein), al Maria (Friedrichshein tb), al YAAM (una playa al río donde hacen raves) o ir siguiendo el río en dirección Este desde Schlessisches Tor, ya que hay bastantes garitos y también un bar donde te puedes sentar en balsas en el río en plan chill out.
Espero que esto te sirva para hacerte una idea.