Para que el motor arranque necesita gasolina y chispa, tendras que comprobar que es lo que le falta. Asegurate de oir el caracteristico zumbido de la bomba cuando das al contacto, como has desmontado el deposito para cambiar el relé y quizas el cableado del bombin a lo mejor has dejado el conector de la bomba mal, o algun cable se ha salido. Ese conector suele dar problemas.
Si la bomba funciona se supone que la gasolina llegará al motor, pero puedes desconectar el manguito que va al rail de los inyectores y darle al contacto a ver si sale un buen chorro.
Si llega gasolina, te tocará sacar alguna bujia y ver si da chispa. El sensor Hall que te comentan es el que le dice a las bobinas cuando soltar la chispa, hay muchas cosas que mirar antes de meterle mano y no es economico precisamente, creo que 350 ó 400 eurillos de nada en concesionario. No suelen fallar de golpe, avisan con tiempo, y aunque se de algunos a quienes les ha fallado, tampoco diría que es un punto flaco de estas motos.
Como no comentas un fuerte olor a gasolina cuando tratas de arrancarla, que seguramente notarias si no hay chispa, me inclino mas por falta de suministro de gasofa.
Los relés de arranque pegados por culpa de bateria floja son muy comunes, muchos :

llevamos los contactos del relé lijados por el mismo problema, pero aparte del susto de arrancar "sola" en cuanto pones la bateria nueva nunca he oido de ninguna consecuencia como la que comentas, así que ha tenido que pasar algo mas, mira bien a ver lo que has hecho en la moto desde entonces.
Suerte.
has acertado, he comprobado lo de la gasolina y no sale ni una gota cuando le doy al contacto, tampoco hace el ruido tan caracterisitico de la bomba, he comprobado las conexiones que he podido manipular durante el cambio del rele de arranque y aparentemente todas estan bien. Debo entender que se ha estropeado la bomba de la gasofa, o existe algun rele que alimente a esta bomba? tienes idea del precio y donde podria pillarla de segunda mano?
muchas gracias por tus conocimientos.
se agradece cuando uno esta perdido.