Hola
tengo una 1100 gs y un problema parecido. Entre 4000 y 4500 revoluciones y en 4ª y 5ª me pega unos tironcillos cuando acelero bruscamente para adelantar, cuando paso de estas revoluciones se le quita; es como si se ahogara, parece un problema de alimentación.
Esto hace como 20 días que me apareció y como no ha parado de llover me ha sido imposible hacerle más pruebas a la moto, aunque lo último que le he hecho es echarle un limpia inyectores, de esos que se compran en la gasolinera y se añaden a la gasolina y me parece que ha mejorado bastante.
Si tu problema es parecido, te aconsejaría que revisaras el filtro del aire, las bujías y todas las gomas de admisión, incluyendo los tapones donde se conecta el vacuòmetro.
Si me entero de algo más te lo comento. Y a ver si el tiempo nos deja poner nuestras motos apunto.
saludos.