Te aseguro que tengo en gran estima tus puntos de vista.
Y esta opinión tuya no caerá en saco rato.
Seguro que sacas un rato para rebatirla, tú que has demostrado saber algo de esto.
Veamos... me disculpo si explico cosas que todos sabéis o si utilizo un lenguaje muy plano. No se. Voy a hacer un intento con la PCR..
Empecemos por el SARS-CoV-2.
Es un virus ARN. Su material genético es ARN (el nuestro es ADN). Como bien ha comentado
@Francesc anteriormente, existen diferentes coronavirus. El SARS-CoV-2 es uno de ellos. Todo ellos tienen ARN como material genético. La información genética esta escrita en el orden de los componentes de ese ARN. El ARN es una molécula formada por la unión de esos cuatro componentes. Los llamaremos A, U, C y G para abreviar. Son las letras del abecedario del ARN. La molécula de ARN que lleva la información del SARS-CoV-2 tiene unas 30000 letras. Esa es la longitud del libro de instrucciones del SARS-CoV-2. Ese libro lleva la instrucción para la síntesis de al menos 27 proteínas víricas. Entre ellas la famosa proteína "spike" (espícula;S).
Si comparamos el libro de instrucciones de los diferentes coronavirus, vemos que se parecen mucho. Buena parte del "texto" es idéntica entre ellos (al igual que se parece mucho nuestro "texto genético" con el de los demás monos o incluso otros mamíferos). Pero una parte del texto es distinta. Hay pequeñas variaciones en esa secuencia de letras que son las que determinan que se trate de virus diferentes. Así que si queremos detectar específicamente uno de los virus por PCR lo que tenemos que hacer es utilizar esas variaciones que solo se encuentran en el virus que nos interesa.
No recuerdo bien si fue a finales de enero o principio de febrero de 2020, se secuenció ese libro de instrucciones del SARS-CoV-2. Y eso fue un hito fundamental en todo lo que vino a continuación (incluyendo el desarrollo de las vacunas). Cuando digo secuenció me refiero a que se supo exactamente el orden en que estaban dispuestas esas cuatro letras en la molécula de ARN del virus. A partir de ahí, se pudo comparar con el texto de los otros coronavirus y se vieron que "palabras" de ese libro de instrucciones eran diferentes respecto al resto de virus (coronavirus y otros; existen varias bases de datos donde están públicamente todas las secuencias completas o parciales de los genes de todos los organismos que conocemos).
Hasta aquí espero que quede claro que hay "palabras" de ese libro que solo existen en el SARS-CoV-2, aunque el 90% del texto sea idéntico (me invento el porcentaje) al de los otros virus de la familia de los Coronaviridae.
Sigamos con la PCR.
Haciendo un resumen muy básico, en la PCR lo que se hace es amplificar (hacer muchas copias) de una secuencia de ADN o ARN (una de esas "palabras" que componen la instrucción para una proteína vírica, por ejemplo). En unas cuatro horas puede hacer 1 millón de copias de una "palabra" (término correcto seria secuencia). ¿Cómo lo hace?
En primer lugar explicar que el ADN esta formado por dos cadenas formadas por cuatro letras. En el caso del ADN las letras son A, T, C, G (la diferencia con el ARN esta en que en vez de T tiene U). Esas dos cadenas se unen porque las letras se aparean de una manera especifica. La A con la T y la C con la G.
Ahora os pongo una secuencia inventada de un trozo de ADN para que veáis las dos cadenas y como están formando parejas las letras.
ATTAACCGTACCGATGCTTACGTAACGATT
TAATTGGCATGGCTACGAATGCATTGCTAA
Veis que la primera A (de la cadena de arriba) estará unida a una T en la de abajo (y así sucesivamente).
Otro dato, no existen las parejas A-C o A-G etc. Siempre, siempre, siempre las parejas son A-T y C-G.
(Ya se... el SARS-CoV-2 es ARN y me estas explicando noseque del ADN.... paciencia, eso viene luego. Sigamos con la PCR)
Para la PCR lo que se hace es utilizar una pequeña secuencia de letras que sea complementaria a la secuencia ("palabra") que queramos amplificar (esto no es bien bien así, pero es una manera para que se entienda. El procedimiento no es exactamente ese).
Imaginar lo siguiente. En el ejemplo anterior, quiero amplificar la parte que esta en negrita: ATTAACCG
TACCGATGCTTACGTAACGATT. Para ello utilizo una secuencia corta de ADN que sea complementaria a la que me interesa. Seria: ATGGCTACGAATGCAT
Imaginar que, junto con otros componentes hago la PCR (no voy a entrar en todos los detalles) en la que ocurrirá lo siguiente:
ATTAACCG
TACCGATGCTTACGTAACGATT
---------------ATGGCTACGAATGCAT------------
La secuencia corta que yo he sintetizado se unirá a la secuencia complementaria de la molécula que utilizo para amplificar. Si esa complementariedad ocurre, la sucesión de reacción producirán cientos de miles de copias de ESA secuencia. SOLO de esa.
(sigue)....